Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PolkQ9QUG2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms