Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ap3b2Q9JME5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ap3b2Q9JME5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ap3b2Q9JME5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ap3b2Q9JME5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ap3b2Q9JME5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ap3b2Q9JME5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ap3b2Q9JME5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ap3b2Q9JME5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ap3b2Q9JME5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ap3b2Q9JME5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ap3b2Q9JME5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ap3b2Q9JME5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ap3b2Q9JME5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ap3b2Q9JME5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ap3b2Q9JME5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ap3b2Q9JME5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ap3b2Q9JME5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ap3b2Q9JME5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ap3b2Q9JME5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ap3b2Q9JME5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ap3b2Q9JME5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ap3b2Q9JME5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ap3b2Q9JME5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ap3b2Q9JME5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ap3b2Q9JME5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ap3b2Q9JME5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ap3b2Q9JME5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ap3b2Q9JME5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ap3b2Q9JME5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3b2Q9JME5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms