Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rabgef1Q9JM13 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rabgef1Q9JM13 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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