Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms