Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

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Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms