Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms