Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nova1Q9JKN6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms