Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms