Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cyp39a1Q9JKJ9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cyp39a1Q9JKJ9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms