Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms