Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uchl3Q9JKB1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.3 ms