Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ddx20Q9JJY4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms