Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sv2aQ9JIS5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms