Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ercc6l2Q9JIM3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms