Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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