Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESE1

Lrba, Lipopolysaccharide-responsive and beige-like anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LrbaQ9ESE1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms