Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ush1cQ9ES64 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms