Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Usp29Q9ES63 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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Usp29Q9ES63 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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Usp29Q9ES63 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
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Usp29Q9ES63 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Usp29Q9ES63 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Usp29Q9ES63 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Usp29Q9ES63 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Usp29Q9ES63 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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Usp29Q9ES63 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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