Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cpsf1Q9EPU4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cpsf1Q9EPU4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cpsf1Q9EPU4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cpsf1Q9EPU4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cpsf1Q9EPU4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cpsf1Q9EPU4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cpsf1Q9EPU4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cpsf1Q9EPU4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cpsf1Q9EPU4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cpsf1Q9EPU4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cpsf1Q9EPU4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cpsf1Q9EPU4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cpsf1Q9EPU4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Cpsf1Q9EPU4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cpsf1Q9EPU4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cpsf1Q9EPU4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cpsf1Q9EPU4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cpsf1Q9EPU4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cpsf1Q9EPU4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cpsf1Q9EPU4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cpsf1Q9EPU4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cpsf1Q9EPU4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cpsf1Q9EPU4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cpsf1Q9EPU4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cpsf1Q9EPU4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cpsf1Q9EPU4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cpsf1Q9EPU4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cpsf1Q9EPU4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cpsf1Q9EPU4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cpsf1Q9EPU4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cpsf1Q9EPU4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cpsf1Q9EPU4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cpsf1Q9EPU4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cpsf1Q9EPU4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cpsf1Q9EPU4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Cpsf1Q9EPU4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cpsf1Q9EPU4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cpsf1Q9EPU4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cpsf1Q9EPU4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cpsf1Q9EPU4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cpsf1Q9EPU4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cpsf1Q9EPU4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cpsf1Q9EPU4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cpsf1Q9EPU4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cpsf1Q9EPU4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Cpsf1Q9EPU4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cpsf1Q9EPU4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cpsf1Q9EPU4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cpsf1Q9EPU4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cpsf1Q9EPU4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cpsf1Q9EPU4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cpsf1Q9EPU4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms