Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL6

Mmp1b, Interstitial collagenase B, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1bQ9EPL6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp1bQ9EPL6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp1bQ9EPL6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp1bQ9EPL6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp1bQ9EPL6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp1bQ9EPL6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp1bQ9EPL6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp1bQ9EPL6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp1bQ9EPL6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp1bQ9EPL6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp1bQ9EPL6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp1bQ9EPL6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp1bQ9EPL6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp1bQ9EPL6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp1bQ9EPL6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp1bQ9EPL6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp1bQ9EPL6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp1bQ9EPL6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp1bQ9EPL6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp1bQ9EPL6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp1bQ9EPL6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp1bQ9EPL6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp1bQ9EPL6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp1bQ9EPL6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp1bQ9EPL6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp1bQ9EPL6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp1bQ9EPL6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp1bQ9EPL6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms