Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpr88Q9EPB7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpr88Q9EPB7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpr88Q9EPB7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpr88Q9EPB7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr88Q9EPB7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr88Q9EPB7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr88Q9EPB7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr88Q9EPB7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr88Q9EPB7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr88Q9EPB7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr88Q9EPB7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr88Q9EPB7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr88Q9EPB7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr88Q9EPB7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr88Q9EPB7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr88Q9EPB7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr88Q9EPB7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr88Q9EPB7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr88Q9EPB7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr88Q9EPB7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr88Q9EPB7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpr88Q9EPB7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpr88Q9EPB7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpr88Q9EPB7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpr88Q9EPB7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpr88Q9EPB7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms