Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms