Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms