Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9DA42 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9DA42 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9DA42 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9DA42 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9DA42 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9DA42 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9DA42 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9DA42 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9DA42 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9DA42 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9DA42 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9DA42 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9DA42 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9DA42 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9DA42 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9DA42 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9DA42 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9DA42 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9DA42 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9DA42 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9DA42 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9DA42 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9DA42 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9DA42 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9DA42 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9DA42 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9DA42 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9DA42 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9DA42 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9DA42 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9DA42 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9DA42 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9DA42 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9DA42 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9DA42 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9DA42 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9DA42 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9DA42 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9DA42 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9DA42 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9DA42 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9DA42 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9DA42 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9DA42 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9DA42 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9DA42 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9DA42 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9DA42 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9DA42 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9DA42 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9DA42 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9DA42 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9DA42 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9DA42 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9DA42 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9DA42 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Q9DA42 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q9DA42 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q9DA42 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Q9DA42 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9DA42 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9DA42 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9DA42 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9DA42 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9DA42 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9DA42 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9DA42 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9DA42 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9DA42 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9DA42 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9DA42 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9DA42 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9DA42 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9DA42 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9DA42 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9DA42 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9DA42 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9DA42 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9DA42 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9DA42 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9DA42 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9DA42 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9DA42 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9DA42 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9DA42 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9DA42 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9DA42 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9DA42 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9DA42 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9DA42 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9DA42 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9DA42 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9DA42 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9DA42 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9DA42 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9DA42 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9DA42 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9DA42 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9DA42 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms