Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Smco2Q9DA21 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smco2Q9DA21 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smco2Q9DA21 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Smco2Q9DA21 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Smco2Q9DA21 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smco2Q9DA21 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smco2Q9DA21 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smco2Q9DA21 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smco2Q9DA21 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smco2Q9DA21 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smco2Q9DA21 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smco2Q9DA21 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smco2Q9DA21 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smco2Q9DA21 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smco2Q9DA21 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smco2Q9DA21 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smco2Q9DA21 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms