Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzd9Q9D9M4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pdzd9Q9D9M4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdzd9Q9D9M4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdzd9Q9D9M4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdzd9Q9D9M4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdzd9Q9D9M4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdzd9Q9D9M4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdzd9Q9D9M4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
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