Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q9D9H8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Q9D9H8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q9D9H8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q9D9H8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q9D9H8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Q9D9H8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Q9D9H8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Q9D9H8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q9D9H8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Q9D9H8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Q9D9H8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Q9D9H8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Q9D9H8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Q9D9H8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Q9D9H8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Q9D9H8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Q9D9H8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Q9D9H8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Q9D9H8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Q9D9H8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Q9D9H8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Q9D9H8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms