Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tvp23bQ9D8T4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms