Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan17Q9D7W4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms