Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms