Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Capns2Q9D7J7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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