Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ptp4a3Q9D658 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ptp4a3Q9D658 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptp4a3Q9D658 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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