Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Speer4f1Q9D5Q6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms