Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Ubxn11Q9D572 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Ubxn11Q9D572 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn11Q9D572 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms