Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc7Q9D541 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms