Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms