Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms