Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.6 ms