Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpn3Q9D3W4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms