Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms