Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1K7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1K7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1K7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1K7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1K7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D1K7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D1K7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D1K7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D1K7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D1K7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D1K7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D1K7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D1K7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms