Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gtf2e1Q9D0D5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms