Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pbdc1Q9D0B6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pbdc1Q9D0B6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pbdc1Q9D0B6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pbdc1Q9D0B6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pbdc1Q9D0B6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pbdc1Q9D0B6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pbdc1Q9D0B6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pbdc1Q9D0B6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pbdc1Q9D0B6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pbdc1Q9D0B6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pbdc1Q9D0B6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pbdc1Q9D0B6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pbdc1Q9D0B6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pbdc1Q9D0B6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pbdc1Q9D0B6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pbdc1Q9D0B6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pbdc1Q9D0B6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pbdc1Q9D0B6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pbdc1Q9D0B6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms