Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Snx7Q9CY18 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms