Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Exo5Q9CXP9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms