Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psmd8Q9CX56 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmd8Q9CX56 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmd8Q9CX56 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmd8Q9CX56 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmd8Q9CX56 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmd8Q9CX56 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmd8Q9CX56 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmd8Q9CX56 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmd8Q9CX56 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmd8Q9CX56 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmd8Q9CX56 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmd8Q9CX56 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmd8Q9CX56 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmd8Q9CX56 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmd8Q9CX56 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmd8Q9CX56 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmd8Q9CX56 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmd8Q9CX56 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmd8Q9CX56 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmd8Q9CX56 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmd8Q9CX56 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmd8Q9CX56 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmd8Q9CX56 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmd8Q9CX56 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms