Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms