Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxxc1Q9CWW7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms