Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Smyd3Q9CWR2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smyd3Q9CWR2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Smyd3Q9CWR2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smyd3Q9CWR2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smyd3Q9CWR2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smyd3Q9CWR2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smyd3Q9CWR2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smyd3Q9CWR2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smyd3Q9CWR2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smyd3Q9CWR2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smyd3Q9CWR2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smyd3Q9CWR2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smyd3Q9CWR2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smyd3Q9CWR2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smyd3Q9CWR2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smyd3Q9CWR2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smyd3Q9CWR2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smyd3Q9CWR2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smyd3Q9CWR2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smyd3Q9CWR2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smyd3Q9CWR2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smyd3Q9CWR2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smyd3Q9CWR2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smyd3Q9CWR2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smyd3Q9CWR2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smyd3Q9CWR2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smyd3Q9CWR2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smyd3Q9CWR2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smyd3Q9CWR2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms