Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atxn3Q9CVD2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Atxn3Q9CVD2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms